Заметка о аутосомном генофонде беларусов.Часть III

В начале нового года я решил обновить данные экспериментов с аутосомными снипами беларусов. Обновление в силу схожести методологических приемов будет затрагивать главным образом результаты анализа беларуского генофонда в программе ALDER (технические детали и дизайн эксперимента обсуждались в предыдущих заметках).

В качестве заметки на полях отмечу, что в ходе своих предыдущих экспериментов я убедился в том, что наилучшие результаты дает запуск рабочего цикла программы без указания дефольтных размеров «окон» SNP-ов, в которых и происходит анализ корреляции угасания генетического сцепления.

С целью поддержки совместимости с предыдущими экспериментами, я снова отфильтровал результаты последних экспериментов таким образом, чтобы они соответствовали двум параметрам — a) в анализируемой группе беларусов наблюдалась двухсторонняя корреляция с обеими референсными популяциями; 2) согласованность скорости экспонентного угасания генетического сцепления в адмиксе и в обеих референсных популяциях.

Как и ранее, представляю для ознакомления сводную таблицу, наиболее интересную часть которой должны представлять колонки с возрастом адмикса (в поколениях), датированным на основании наблюдаемого уровня угасания генетического сцепления (выделены красным).

Для начала результат анализа данных собранных по беларуссом в моем научно-исследовательском проекте MDLP (Belorussian_V).

Belarusian_V Lithuanian_V Russian_cossack 36.98+/-3.75
Belarusian_V Lithuanian_V Avar 44.15+/-4.72
Belarusian_V Lithuanian_V Ukrainian 42.14+/-5.22
Belarusian_V Lithuanian_V Abhkasian 42.85+/-5.42
Belarusian_V Lithuanian_V Russian_V 42.09+/-5.02
Belarusian_V Lithuanian_V Russian_Center 42.75+/-5.98
Belarusian_V Lithuanian_V Serbian 48.86+/-7.35
Belarusian_V Lithuanian_V Ukrainian-East 43.69+/-5.89
Belarusian_V Lithuanian_V Cirkassian 43.91+/-7.97
Belarusian_V Lithuanian_V Kumyk 41.10+/-5.98
Belarusian_V Russian_North Belarusian 40.66+/-9.63

Таблица наглядно иллюстрирует географические и хронлогические особенности адмикса. Основу (cубстрат) адмикса составляют популяции похожие на популяции современных литовцев и русских из северной части РФ. Вторую часть — популяции с характерным балкано-кавказским профилем. 

Разброс датировок адмикса также попадает в один интервал (примерно 1450-870 лет до настоящего времени, или в более привычной датировке — VI-XI в. н.э). Это период начала экспансии славян, в ходе которой происходило смешивание с различными балтийскими, фрако-иллирийскими и кавказскими племенами.

Это не первый случай, когда наблюдаемая в геноме закономерность хорошо согласуется с историческими сведениями.

Анализ академической выборки беларусов из коллекции Эстонского Биоцентра в городе Тарту дал результаты с большей временной и спатиальной амплитудой. Поэтому пришлось проводить дополнительную фильтровку данных и выбрать те результаты, которые попадают в ту же хронологическую шкалу, что и результаты первой группы беларусов.

Belarusian Ossetian Saami 49.07+/-4.89
Belarusian Ossetian Norwegian_V 48.9+/-8.66
Belarusian Cirkassian Greek_East 48.72+/-9.97
Belarusian Armenian Greek_North 48.25+/-17.62
Belarusian Greek_Center Norwegian_V 47.07+/-8.74
Belarusian Cirkassian Armenian 46.8+/-11.91
Belarusian Adygei Gagauz 46.79+/-11.34
Belarusian Cirkassian Lezgin 46.34+/-5.87
Belarusian Bashkir Armenian 46.32+/-5.01
Belarusian Lezgin Ossetian 46.23+/-8.39
Belarusian Cirkassian Adygei 45.79+/-10.37
Belarusian Bashkir Sardinian 43.19+/-5.87
Любопытно, что также как и в случае с первой группой беларусов хорошо заметен след генетических контактов с Кавказом и Балканами. Зато северо-европейская составляющая оказалась заменена на скандинавскую примесь (норвежцы и саамы). Но более существенным различием является обнаружение следа контакта со степными тюркскими народами навроде предков башкир.

Реклама

Добавить комментарий

Please log in using one of these methods to post your comment:

Логотип WordPress.com

Для комментария используется ваша учётная запись WordPress.com. Выход / Изменить )

Фотография Twitter

Для комментария используется ваша учётная запись Twitter. Выход / Изменить )

Фотография Facebook

Для комментария используется ваша учётная запись Facebook. Выход / Изменить )

Google+ photo

Для комментария используется ваша учётная запись Google+. Выход / Изменить )

Connecting to %s