Распространение предковых компонентов для калькулятора K36 проекта Eurogenes

Мне показалось интересным создать таблицу распространения предковых компонентов по восточноевропейским и некоторым соседним популяциям для уже довольно старого калькулятора K36 от Поляко (в свое время автор отказался делать по нему оракул. Сам калькулятор имеется на Gedmatch):
Усреднения по восточноевропейским популяциям для K36
Файл для «Оракула четырех предков» по тем же популяциям

Калькулятор вышел «шумным», значения компонентов у отдельных людей заметно плавают. Тем не менее, он любопытен попыткой максимально детализировать генетический портрет Восточной Европы. Можно отдельно выделить распространение некоторых компонентов (в скобках указаны популяции, на основе которых выводился компонент):
Fennoscandian (финны)

Finnish_East    68,85
Estonian    38,32
Russian_North    25,02
Sweden-2    23,70
Russian_Perm    22,26
Russian_Vyatka    21,52
Russian_Novgorod_Yaroslavl    20,61
Komi    17,68
Sweden-1    17,63
Lithuanian    17,14
Russian_Meshtchyora    15,99
Russian_Center    15,04
Erzya    14,85
Belarusian_East    14,57
Russian_Bryansk    14,45
Chuvash    14,30
Mishar_Drozh    13,67
Russian_Kursk    13,63
Russian_Voronezh    13,59
Russian_Smolensk    13,48
Mari    13,35
Mishar_Bashkiria    13,28
Moksha    13,17
Russian_Oryol    12,99
Tatar_Tatarstan    12,93
Belarusian_Polesye    12,80
Tatar_Yunusbaev    12,55
Bashkir    11,30
Udmurt    11,16
Polish    10,86
Ukrainian_East    10,86
Selkup    10,34
Moldavian    9,71
Mishar_Nizhniy    9,10
Ukrainian_West    8,59
Tatar_Siberia    4,13
Carpathian    4,11
Kumyk    3,14
Kazakh    3,01
Kabardinian    2,33
Tabassaran    1,80
Balkarian    0,48
Abkhazian    0,13

East_Central_Euro (Литовцы, белорусы, украинцы)

Lithuanian    34,73
Russian_Bryansk    28,09
Belarusian_East    26,94
Belarusian_Polesye    26,73
Russian_Smolensk    25,43
Russian_Center    25,16
Ukrainian_East    24,91
Polish    24,83
Russian_Kursk    24,22
Russian_Oryol    23,38
Russian_Voronezh    22,78
Russian_Meshtchyora    21,06
Ukrainian_West    20,77
Russian_Novgorod_Yaroslavl    20,33
Estonian    19,00
Russian_Perm    17,97
Moksha    17,89
Russian_North    17,39
Carpathian    17,19
Erzya    16,86
Russian_Vyatka    16,67
Moldavian    16,55
Mishar_Drozh    14,36
Mishar_Nizhniy    13,95
Mishar_Bashkiria    12,89
Tatar_Tatarstan    11,44
Komi    10,80
Tatar_Yunusbaev    10,60
Sweden-2    9,24
Sweden-1    8,92
Chuvash    8,70
Udmurt    8,56
Bashkir    6,82
Mari    5,63
Finnish_East    4,01
Kazakh    3,95
Kumyk    3,91
Tabassaran    3,09
Kabardinian    1,99
Tatar_Siberia    1,47
Balkarian    1,21
Selkup    0,46
Abkhazian    0,00

Eastern_Euro  (Северные русские, эрзя, мокша)

Russian_Vyatka    25,14
Udmurt    24,06
Moksha    22,68
Erzya    22,61
Russian_North    21,07
Russian_Novgorod_Yaroslavl    21,04
Russian_Meshtchyora    20,79
Russian_Perm    20,56
Russian_Kursk    20,15
Russian_Smolensk    20,12
Lithuanian    19,69
Russian_Center    19,69
Russian_Oryol    18,77
Ukrainian_East    18,50
Belarusian_East    18,38
Russian_Voronezh    18,29
Polish    17,48
Komi    17,24
Belarusian_Polesye    16,96
Mari    16,41
Mishar_Drozh    15,89
Russian_Bryansk    15,69
Mishar_Nizhniy    15,20
Ukrainian_West    15,08
Mishar_Bashkiria    14,93
Tatar_Tatarstan    14,91
Bashkir    14,66
Estonian    14,31
Moldavian    14,08
Tatar_Yunusbaev    13,25
Carpathian    13,05
Chuvash    12,38
Tatar_Siberia    11,27
Finnish_East    10,59
Selkup    9,32
Sweden-2    7,20
Sweden-1    6,39
Kazakh    2,96
Kumyk    2,53
Balkarian    2,35
Tabassaran    2,34
Kabardinian    1,15
Abkhazian    0,69

Volga-Ural (Чуваши)

Mari    29,14
Chuvash    26,02
Komi    11,23
Udmurt    10,81
Selkup    10,56
Bashkir    10,54
Tatar_Yunusbaev    9,27
Mishar_Nizhniy    9,15
Mishar_Bashkiria    8,61
Tatar_Tatarstan    8,55
Mishar_Drozh    8,49
Moksha    7,42
Tatar_Siberia    6,58
Erzya    6,47
Russian_Perm    5,89
Russian_North    5,09
Russian_Vyatka    4,98
Russian_Novgorod_Yaroslavl    4,34
Russian_Meshtchyora    3,22
Russian_Voronezh    3,21
Russian_Center    3,19
Belarusian_East    3,03
Carpathian    2,94
Russian_Bryansk    2,94
Estonian    2,84
Russian_Oryol    2,72
Kabardinian    2,63
Ukrainian_East    2,51
Russian_Kursk    2,10
Kazakh    2,09
Moldavian    1,77
Kumyk    1,47
Russian_Smolensk    1,45
Balkarian    1,36
Polish    1,28
Finnish_East    1,27
Belarusian_Polesye    1,20
Ukrainian_West    1,11
Tabassaran    1,07
Sweden-1    0,66
Sweden-2    0,42
Abkhazian    0,13
Lithuanian    0,00

East_Balkan (Румыны, болгары)

Carpathian    8,52
Moldavian    8,26
Russian_Voronezh    7,94
Belarusian_Polesye    7,80
Polish    7,15
Russian_Meshtchyora    6,97
Russian_Smolensk    6,96
Russian_Oryol    6,61
Ukrainian_West    6,37
Belarusian_East    6,23
Russian_Kursk    6,20
Tatar_Tatarstan    6,15
Russian_Center    5,99
Mishar_Nizhniy    5,85
Ukrainian_East    5,45
Erzya    5,33
Russian_Bryansk    5,06
Lithuanian    5,04
Russian_Novgorod_Yaroslavl    4,41
Russian_North    3,89
Tatar_Yunusbaev    3,56
Mishar_Bashkiria    3,52
Chuvash    3,51
Russian_Perm    3,28
Russian_Vyatka    3,28
Estonian    3,22
Tatar_Siberia    2,58
Abkhazian    2,48
Sweden-2    2,46
Moksha    2,32
Komi    2,21
Kumyk    1,86
Sweden-1    1,80
Bashkir    1,55
Mishar_Drozh    1,47
Tabassaran    1,35
Kabardinian    1,11
Finnish_East    0,88
Udmurt    0,79
Mari    0,29
Balkarian    0,27
Kazakh    0,27
Selkup    0,00

North_Caucasian (Адыги, балкарцы, чеченцы, осетины, кумыки)

Tabassaran    41,85
Balkarian    40,18
Kumyk    39,18
Kabardinian    36,82
Abkhazian    35,25
Tatar_Siberia    13,39
Kazakh    9,01
Bashkir    8,37
Mishar_Drozh    8,12
Moksha    7,53
Tatar_Yunusbaev    7,37
Tatar_Tatarstan    7,32
Mishar_Nizhniy    7,24
Udmurt    5,68
Mishar_Bashkiria    5,46
Chuvash    4,75
Erzya    3,63
Russian_Kursk    3,63
Komi    3,51
Russian_Oryol    3,46
Moldavian    3,26
Russian_Meshtchyora    2,68
Russian_Voronezh    2,52
Carpathian    2,41
Russian_Center    2,15
Belarusian_East    2,12
Mari    1,68
Russian_Smolensk    1,34
Russian_Novgorod_Yaroslavl    1,30
Russian_Bryansk    1,24
Polish    1,04
Russian_Perm    0,94
Ukrainian_East    0,86
Russian_Vyatka    0,83
Sweden-2    0,74
Russian_North    0,62
Belarusian_Polesye    0,47
Ukrainian_West    0,24
Sweden-1    0,16
Selkup    0,09
Estonian    0,00
Finnish_East    0,00
Lithuanian    0,00

Siberian (Буряты, чукчи, эвенки, коряки, нганасаны, тувинцы, якуты, юкагиры)

Selkup    60,69
Kazakh    25,54
Tatar_Siberia    25,04
Mari    19,17
Bashkir    17,82
Komi    13,53
Chuvash    13,36
Udmurt    11,50
Tatar_Yunusbaev    11,22
Tatar_Tatarstan    7,36
Mishar_Drozh    7,13
Mishar_Nizhniy    6,61
Russian_Perm    5,73
Mishar_Bashkiria    5,57
Russian_Vyatka    3,85
Erzya    3,62
Kabardinian    2,52
Moksha    2,12
Russian_North    2,12
Kumyk    1,55
Balkarian    1,22
Russian_Novgorod_Yaroslavl    0,74
Russian_Meshtchyora    0,29
Russian_Center    0,01
Abkhazian    0,00
Belarusian_East    0,00
Belarusian_Polesye    0,00
Carpathian    0,00
Estonian    0,00
Finnish_East    0,00
Lithuanian    0,00
Moldavian    0,00
Polish    0,00
Russian_Bryansk    0,00
Russian_Kursk    0,00
Russian_Oryol    0,00
Russian_Smolensk    0,00
Russian_Voronezh    0,00
Sweden-1    0,00
Sweden-2    0,00
Tabassaran    0,00
Ukrainian_East    0,00
Ukrainian_West    0,00

Некоторые компоненты «пикуют» не у тех популяций, на основе которых были выведены. Например, самыми «волжско-уральскими» оказались не чуваши, а марийцы.

Реклама

Распространение предковых компонентов для калькулятора K36 проекта Eurogenes: 2 комментария

  1. Yes, these individuals were not included. Russian_North, Lithuanian, Erzya etc are based on individuals from forum.molgen.org

Добавить комментарий

Please log in using one of these methods to post your comment:

Логотип WordPress.com

Для комментария используется ваша учётная запись WordPress.com. Выход / Изменить )

Фотография Twitter

Для комментария используется ваша учётная запись Twitter. Выход / Изменить )

Фотография Facebook

Для комментария используется ваша учётная запись Facebook. Выход / Изменить )

Google+ photo

Для комментария используется ваша учётная запись Google+. Выход / Изменить )

Connecting to %s