Обновлено 30.11.2014
Этот пост также продолжает один из предыдущих, а именно визуализацию суммы IBD-сегментов (а возможно, это и не IBD — вопрос остается открытым) двух палеоевропейцев и мальчика со стоянки Мальта с современными выборками. С тех пор в открытом доступе появилось еще несколько обработанных палеогеномов — «усть-ишимец«, «Костенки-14» («человек с Маркиной горы») и два палеогенома хорошего качества из Венгрии.
Результаты собраны мной в онлайн-таблицу, а также отрисованы на расширенных картах. Поскольку усть-ишимец явно тяготел к восточноазиатам, пришлось добавить к сравнению выборки из Южной и Восточной Азии. Ну а после этого логика подсказывала, что неолитических земледельцев Европы неплохо бы сравнить с жителями Ближнего Востока. Таким образом, все карты перерисованы.
Напомню также, что результаты для «мальтинца» и «костенковца» получены при ослабленных настройках фильтра из-за низкого качества прочтения этих двух геномов. Напрямую сравнивать их с пятью другими нельзя. Для отрисовки Loschbour значения умножены на 1,5 в целях повышения контрастности.
«Неолитическая фермерша» )) Stuttgart/LBK
«Неолитический земледелец» NE1:
Усреднение по двум земледельцам дает более ровную картинку:
«Охотник-собиратель» Loschbour:
Разница между «охотником-собирателем» и усреднением по двум земледельцам. Красное — больше сегментов с Loschbour, зеленое — c Stuttgart и NE1
Европеец позднего бронзового века BR2 из Венгрии:
«Усть-ишимец»:
Костенки-14 (ослабленные настройки):
Мальтинец (аналогично):
И наконец, в качестве примера результата нашего современника, моя собственная карта:
Заметки о генетике 
Расширенные карты для палеогеномов: Один комментарий